埃及政府负责水行政事务的主管部门是公共工程和水利部（Ministry of Public Works and Water Resources，mPWWR）埃及政府负责水行政事务的主管部门是公共工程和水利部（Ministry of Public Works and Water Resources，mPWWR）。最早成立于1844年，当时称为公共工程局，1864年改为公共工程管理局，以后称为公共工程部。1964年公共工程部改为灌溉部，1987年灌溉部改为公共工程和水利部。该部设有公共事务局、灌溉管理局、机械与电力管理局、公共勘测管理局、公共排水管理局、海洋保护管理局、高坝与阿斯旺高坝研究管理局、水研究中心、西奈北部开发实体等单位。

公共工程和水利部的职能为：负责全国灌溉排水网及有关建筑物的规划、设计、施工、运行和管理；规划和实施水资源开发工程，最佳地开发利用水资源，为农业、工业、生活、航运和发电等提供用水；负责埃及主要水源尼罗河水、地表水与地下水的管理，包括尼罗河上的水库运行、维护和沿岸灌溉用水的分配；制定和实施符合经济发展需要的相关水政策，并制定实施国家农业排水网的相关政策，致力于保持土壤肥力和发展农业生产。

埃及公共工程和水利部下属的水研究中心（Water Research Centre）水研究中心（Water Research Centre）成立于1975年，是埃及主要的水利研究机构。其研究领域包括水资源管理长期政策、水资源评价、灌溉排水技术、阿斯旺高坝建成后的影响等。水研究中心下设有11个研究所。